MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. Y412MC52 plasmid pGYMC5201

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014916	GTT	2	6	44	49	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014916	GTT	2	6	108	113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014916	T	6	6	171	176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014916	TAA	2	6	187	192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014916	A	7	7	210	216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014916	TAG	2	6	277	282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014916	GGA	2	6	285	290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014916	GCC	2	6	1480	1485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014916	CCGG	2	8	1503	1510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014916	GAA	2	6	1541	1546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014916	AAG	2	6	1599	1604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014916	TTTA	2	8	1631	1638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014916	ACA	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014916	T	6	6	1945	1950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014916	AT	3	6	1974	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014916	GGT	2	6	1986	1991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014916	ATAAA	2	10	2007	2016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014916	ATATA	2	10	2023	2032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014916	TTG	2	6	2962	2967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014916	TGT	2	6	2970	2975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014916	CAA	2	6	2989	2994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014916	GAG	2	6	3030	3035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014916	T	6	6	3092	3097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014916	A	6	6	3103	3108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014916	TTC	2	6	3132	3137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014916	TCGC	2	8	3160	3167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014916	TG	3	6	3217	3222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014916	CT	3	6	5896	5901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014916	CCT	2	6	7227	7232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014916	CTGA	2	8	7262	7269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014916	TCC	2	6	9809	9814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014916	A	6	6	9857	9862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014916	TAA	2	6	9908	9913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014916	AT	4	8	9919	9926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014916	TA	3	6	9971	9976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014916	T	7	7	9993	9999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014916	ATA	2	6	11452	11457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014916	ATT	2	6	11489	11494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014916	TAA	2	6	11505	11510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014916	GAA	3	9	11534	11542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014916	TA	3	6	11545	11550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014916	TAG	2	6	11621	11626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014916	CAG	2	6	11685	11690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014916	AGG	2	6	11692	11697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014916	GATT	2	8	11718	11725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014916	T	6	6	11724	11729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014916	A	6	6	11760	11765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014916	GGGA	2	8	11772	11779	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014916	CGC	2	6	11782	11787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014916	GGAG	2	8	11793	11800	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014916	AG	3	6	11831	11836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014916	GGAG	2	8	11897	11904	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014916	GAG	2	6	12071	12076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014916	CGC	2	6	12082	12087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014916	C	6	6	12117	12122	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_014916	TGA	2	6	12235	12240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014916	ACCGA	2	10	12271	12280	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014916	GTC	2	6	12288	12293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014916	TG	3	6	12317	12322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014916	CTA	2	6	12349	12354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014916	GAA	2	6	12390	12395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014916	CACTTC	2	12	12429	12440	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014916	CA	3	6	12447	12452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014916	GC	3	6	12489	12494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014916	TTC	2	6	12585	12590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014916	ACA	2	6	12640	12645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014916	CAG	2	6	12652	12657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014916	TTGA	2	8	12699	12706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014916	TCC	2	6	12724	12729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014916	GCC	2	6	12746	12751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014916	C	6	6	12754	12759	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_014916	GTC	2	6	12767	12772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014916	GGA	2	6	12787	12792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014916	AGA	2	6	12794	12799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014916	ACAG	2	8	12808	12815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014916	ACC	2	6	13113	13118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014916	AAG	2	6	13990	13995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014916	AAAC	2	8	14031	14038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014916	A	6	6	14287	14292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014916	TAAA	2	8	14293	14300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014916	T	6	6	14310	14315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014916	TAT	2	6	14396	14401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014916	TCA	2	6	14425	14430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014916	GAG	2	6	14518	14523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014916	TTG	2	6	14641	14646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014916	ATCAT	2	10	14679	14688	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014916	ACCA	2	8	14690	14697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014916	TAA	2	6	14728	14733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014916	AATC	2	8	14773	14780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014916	C	7	7	14875	14881	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_014916	ATG	2	6	14891	14896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014916	AAC	2	6	14903	14908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014916	AGCA	2	8	14942	14949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014916	ATA	2	6	14961	14966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014916	CGA	2	6	14973	14978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014916	CCCT	2	8	16322	16329	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_014916	AAC	2	6	16338	16343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014916	CG	3	6	16352	16357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014916	AC	3	6	16412	16417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014916	TCC	2	6	16524	16529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014916	ATTT	2	8	16530	16537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014916	ATC	2	6	16543	16548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014916	A	7	7	16821	16827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014916	GCG	2	6	16849	16854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014916	GCAG	2	8	16893	16900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014916	CTT	2	6	16925	16930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014916	CCGG	2	8	16962	16969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014916	AGG	2	6	16983	16988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014916	GAA	2	6	17055	17060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014916	ATT	3	9	17112	17120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014916	ATC	2	6	17121	17126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014916	TTAT	2	8	17129	17136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014916	AGC	2	6	17156	17161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014916	CGGATG	2	12	17199	17210	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014916	AGT	2	6	17274	17279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014916	ACA	2	6	17750	17755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014916	T	6	6	17760	17765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014916	A	6	6	17773	17778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014916	ATG	2	6	17822	17827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014916	G	6	6	17837	17842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014916	T	6	6	17848	17853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014916	A	6	6	17889	17894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014916	CGA	2	6	19962	19967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014916	A	7	7	21283	21289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014916	CACC	2	8	22394	22401	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_014916	TTC	2	6	22403	22408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014916	GTTT	2	8	22413	22420	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014916	CTT	2	6	22421	22426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014916	TAT	2	6	22434	22439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014916	AAT	2	6	22481	22486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014916	ATAC	2	8	22511	22518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014916	CAA	2	6	22543	22548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014916	CAAA	2	8	22574	22581	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014916	GA	3	6	22612	22617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014916	TAT	2	6	24317	24322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014916	A	6	6	24348	24353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014916	T	6	6	24385	24390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014916	A	6	6	24495	24500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014916	A	7	7	24517	24523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014916	ATT	2	6	26630	26635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014916	TAT	2	6	26652	26657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014916	ATCT	2	8	26665	26672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014916	ACG	2	6	26677	26682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014916	TGA	2	6	26710	26715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014916	A	6	6	26739	26744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014916	ACA	2	6	26753	26758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014916	AAC	2	6	26780	26785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014916	GAA	2	6	26982	26987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014916	ATA	2	6	27025	27030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014916	TGC	2	6	27039	27044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_014916	T	6	6	31641	31646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.